Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- biolab_brussels_research [2019/12/23 14:23] – [17/12/2019] nergiz_dukan
+++ biolab_brussels_research [2021/05/05 17:30] (current) – [17/12/2019] ami
@@ Line 108: / Line 108: @@
 Presentatie 'Smell of the Hive' in kleine ronde kolfjes.
 Propolis en Pollen destillaat genomen van de eerste destillatie.
-{{gallery>:openbiolabresearch:experiments-home}}
 BG11 meegenomen naar studio thuis voor DIY experimenten. Gebruik vanaf nu BG11 voor de Synechocystis en Spirogyra culturen, dit geeft veel beter resultaat dan het zelfgemaakte soil-water medium.
 Subcultuur Synechocystis opgezet en cultuur in grote aquarium aangevuld met BG11.
+{{gallery>:openbiolabresearch:experiments-home}}
+__Bioreactor data: 21/10/2019__ (periode 12 sept.2019 tot 4 okt.2019, 4 laatste fotoos)
+De losse pngs geven iets duidelijker het verloop aan (hogere dus meer resolutie).
+=>
+Wat OD betreft, dit is een vector die  bestaat uit de 3 rgb metingen en de bijhorende weerstand.
+vMax = ³√(3*1024^2) = 1024 (maximale waarde die gemeten kan worden: vloeistof is transparant)
+vMet = ³√(r^2+g^2+b^2) (de gemeten waarde)
+od = 100 - ( vMet / ( vMmax / 100 ) ) (herleid naar procenten, we draaien het percentage om omdat we de dichtheid meten en niet de transparantie)
+__Bioreactor data: 23/12/2019 tot 6/1/2020__ (eerste foto)
+Eerste graph dd. 23/12 tot 6/1=> de cyanobacteria zijn niet gelukkig, hun ontwikkeling zakt zienderogen naar beneden. Reden is dat de verwarming uitstond tijdens de Kerstperiode. Men kan zien dat van 23 tot 27 er nog een normale temperatuur was van ongeveer 21°C. Vanaf 28 gaat de temperatuur over 3 dagen naar 10°C en zowel de pH als de OD volgens deze daling.pH zakt van 7.30 naar 6.25, terwijl de relatieve OD zakt van 20 naar 10. Ook waren de transparante buisjes redelijk 'geclogt' met aaneengekookte bacteria.
+Een voor de bacteria aangename temperatuur (minimum van 21°C maar beter nog hoger, tot 25°C) is dus noodzakelijk voor een goede ontwikkeling!
+{{gallery>:openbiolabresearch:bioreactor-data}}
 =====17/09/2019=====
 van de 3 Purple Bacteria culturen zijn gecontamineerd. De Rhodospirillum rubrum doet het nog goed.
@@ Line 145: / Line 156: @@
 =====08/10/2019=====
 harvested biofilms
+Informatie over cyanobacteria & synthetic biology: given by Prof. Annick Wilmotte <awilmotte@uliege.be>
+Note that as a culture collection, we are always interested by outreach activities with artists. We are also member of the Belgian Consortium of culture collections (BCCM) including bacteria and fungi. So, if Ms Maes was ever interested, I am sure that the BCCM collections would be eager to collaborate, provide material, etc...
+For cyanobacteria & synthetic biology, I advise to contact Prof. Tamagnini, Porto University (pmtamagn@ibmc.up.pt) :https://www.i3s.up.pt/research-group?x=5
 =====18/10/2019=====
@@ Line 375: / Line 392: @@
 Goals:
 )Acetlyation with dry sheets
-)Mıcroscobic pictures
+)Microscopic pictures
-)Dıscuss for the smells
+)Discussion on the smells
 )Acetylation of dried skins (continuation of method 2)
@@ Line 383: / Line 400: @@
 Then the skin is rinsed and waited in the 125ml distilled water+ 375ml ethanol solution
 {{gallery>:openbiolabresearch:acetylation}}
+De tweede skin (iodine method) is heel perkament-achtig geworden als ze gedroogd is. Ze is precies wel heel sterk geworden (in de zin dat de verschillende lagen echt totaal in mekaar 'versmolten' zijn) maar de oppervlakte voelt eerder 'papier' aan, dan 'leer'. Ik bedoel: er zit totaal geen 'olie-achtig' gevoel meer op de oppervlakte. Maar het is wel mooi. Ik zou dit experiment graag nog eens herhalen op een groter oppervlak skin.
 ) Mıcroscopic observations
@@ Line 416: / Line 434: @@
 =====17/12/2019=====
-Observations: We will only work with Cynecosystis and Spiriluna
+Observations: We will only work with Synecocystis and Spiriluna
+__Goals for the day:__
-Goals:
 a) More medium for Spiriluna will be prepared
 b) Beehive odors will be prepared
+__
+Methods:__
+Differrent concentrations of beehive odors are prepared with different ingredients.
+They are listed below, from 1 to 7.
+ml wax
+ml propolis
+ml pollen
+   Smell: Like smooth propolis and wax. We could not detect the smell of pollen.
-Methods:
+ml wax
+ml propolis
+ml pollen
+,5ml dead bees
+   Smell: More beehive, more animalistic, more waxy// to nice to and fresh for hive, parfume like
-b) Differrent concentrations of beehive odors are prepared with different ingredients.
+,5ml wax
+,5ml propolis
+   Smell: More waxy, so fresh for hive
-) 1ml wax
+ml pollen
-ml propolis
+ml dead bees
-ml pollen
-Smell: Like smooth propolis and wax. We could not detect the smell of pollen.
-) 1ml wax
-ml propolis
-ml pollen
-,5ml dead bees
-Smell: More beehive, more animalistic, more waxy// to nice to and fresh for hive, parfume like
-) 1,5ml wax
-,5ml propolis
-Smell: More waxy, so fresh for hive
-) 1ml pollen
-ml dead bees
 ,5ml wax
 ,5ml propolis
+   Smell: Less waxy, more dead bees, nice, more close to beehive odor
-Smell: Less waxy, more dead bees, nice, more close to beehive odor
+,5ml wax
+ml propolis
+ml dead bees
+ml pollen
+   Smell: Soft
+   +0,1ml (2 drops) furfurol (vanilla/ almond, synthetic aroma)
+   Smell: Too much aroma
+   +0,5ml wax
+ml propolis
+   Smell: Better
-) 0,5ml wax
+ml dead bees
-ml propolis
+ml pollen
-ml dead bees
+ml wax
-ml pollen
-Smell: Soft
+ml wax
+ml propolis
-+0,1ml (2 drops) furfurol (vanilla/ almond)
+ml dead bees
+ml pollen
-Smell: Too much aroma
+,1 cinnamoldeyhyde (synthetic aroma) (almost 2drops)
+   Smell: Too much cinnamon aroma
-+0,5ml wax
+   + 0,5ml dead bees
+,5ml propolis
+,5ml wax
+   Smell: Still to much cinnamon
+   + 1ml dead bees
 ml propolis
+ml pollen
+ml wax
+  Smell: Still to much dominant cinnamon
-Smell: Better
+Conlusion: Odor 4 is the closest to beehive. Odor 5 is also in the spectrum.
-) 1ml dead bees
+=====17/01/2021=====
-ml pollen
+prepareren cellen voor tentoonstelling WOVEN BY NATURE
-ml wax
-) 2ml wax
+- altijd werken met Agarose Standard (for elektrophorese - Carl Roth) - Art.nr.3810.2
-ml propolis
+- Phytagel en andere agar agar zijn NIET goed om te werken met Synechocystis
-ml dead bees
+- 1 glazen cel is ong. 300ml van inhoud
-ml pollen
+=> 300ml + 4gr agarose in microwave (meestal 2 x 3 minuten)
-,1 cinnamoldeyhyde (almost 2drops)
+=> ± 20 min. destilleren in drukketel
+=> 8 ml alga-grow toevoegen en cellen vullen
+=> laten afkoelen tot ± 37°C en ± 10ml Synechocystis inspuiten
-Smell: Too much cinnamon aroma
+\\
+=====Rapport Innovatieve Partnerprojecten=====
+Het partnerproject Sensorial Skin was een samenwerking met het Open Biolab van de Erasmus Hogeschool op de Campus Jette. Het project startte in januari 2019 en liep tot eind november 2019.
+Het onderzoek start vanuit mijn activiteit als kunstenaar/imker. Reeds meerdere jaren bestudeer ik de ecosystemen van bijenkolonies die overleven in stedelijke omgevingen. In mijn samenwerking met het OpenBiolab onderzoek ik de mogelijkheid om een biosensor te ontwikkelen die omgevingspollutie kan meten in de buurt van de bijenkasten. De sensor bestaat uit een biofilm die gevormd wordt door reeksen vervlochten kettingen van cyanobacteria (die op deze manie een ‘mat’ weven). Ze communiceren onderling en kunnen samen veranderingen in hun omgeving uitdrukken. Wanneer de bacterie-community gestresseerd wordt door het overschrijden van een bepaalde pullutiegraad, communiceren ze dit door van kleur te veranderen en zo een waarschuwing uit te sturen.
+Het onderzoek in Het Open BioLab omvatte volgende onderdelen:
+**In kaart brengen van het ecosysteem in/rond de beehive**: - analyse van de componenten uit de beehive (nectar/propolis/wax/bees/pollen) via distillatie, om zo te komen tot een ‘geur’ die eigen is aan een bepaalde beehive.
+**‘Strikes’ maken** van bepaalde elementen in en rond de bijenkast en deze opkweken in het lab, om op deze manier goedaardige bacteria te isoleren die als symbiont leven binnen het ecosysteem van de bijenkolonie. Deze bacteria zouden kunnen ingezet worden als basis van de biosensor.
+Onderzoek naar soorten Cyanobacteria en de formatie van Biofilms: - opkweken en bestuderen van verschillende soorten cyanobacteria: Synechocystis spp, Spirulina, Oscillatoria, Anabaena. De biofilmformatie en de kettingvorming zijn, naast de quorum sensing (het communicatie mechanisme van bacteria), de elementen die ik gedetailleerd onderzocht heb in experimenten en veel microscopisch onderzoek, en die ik in artistiek werk verwerkt heb.
+Een nieuwe installatie die ik gedurende mijn partnership ontwikkelde zal in bioart festivals getoond worden in 2020.
+**Samenwerkingen met andere organismen:**
+(Cyano)bacteria die samenleven met korstmossen (lichen) en die zo hun veerkracht kunnen behouden in diverse weersmodellen (koud/warm).
-+ 0,5ml dead bees
+**Innovatief Project:** Het project 'Sensorial Skin' is gedurfd, innovatief en artistiek. Het daagt uit op verschillende domeinen, zowel in de kunsten als in de wetenschappen en het negeert de tweedeling cultuur/natuur. De verschillende domeinen lopen in mekaar over. Als kunstenaar/imker voer ik artistiek onderzoek dat verder gaat dan de platgetreden paden van het wetenschappelijk onderwerp: ‘de bijensterfte’. In dagen van klimaatverandering en vermindering van biodiversiteit moeten we het onderzoek op een meer speculatieve manier durven voeren, o.a. onderzoek naar nieuwe materialen en (onverwachte) samenwerkingen tussen organismen van verschillende soorten. De bioart heeft -naast zijn artistiek onderzoek- ook een sociale functie te vervullen. In tijden waar de bevolkingsaangroei explosief is moeten burgers andere samenlevingsmodellen met de natuur aangaan om zo het model van ‘groene steden’ vorm te geven. Hier heeft de ‘citizen science’ een belangrijke rol te vervullen. Via het publiek maken van het artistiek onderzoek kan er op een intrigerende en onderzoekende manier gedaan worden aan ‘awareness raising’ educatie. Het project ‘Sensorial Skin’ draagt op zijn manier zeker bij aan deze verandering van ‘mindset’.
-,5ml propolis
-,5ml wax
-Smell: Still to much cinnamon
-+ 1ml dead bees
-ml propolis
-ml pollen
-ml wax
-Smell: Still to much dominant cinnamon
-Conlusion: Odor 4 is the closest to beehive. Odor 5 is also in the spectrum.