biolab_brussels
Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revisionLast revisionBoth sides next revision | ||
biolab_brussels [2018/09/30 09:17] – [to check] ami | biolab_brussels [2019/02/05 11:43] – [biofilms] ami | ||
---|---|---|---|
Line 1: | Line 1: | ||
=====Biolab Brussels===== | =====Biolab Brussels===== | ||
- | + | Workshops and research | |
- | =====consortium Biolabs===== | + | http:// |
- | Open Biolab Brussels | + | |
- | DIY Bio Barcelona | + | |
- | Universiteit Antwerpen - Lab Microbiologie | + | |
- | Synergetica Lab Amsterdam | + | |
- | Hybrid Forms Lab VU Amsterdam (Raoul Frese) | + | |
- | partners: VUB Brussels (chemical engineering), | + | |
- | + | ||
- | \\ | + | |
- | + | ||
- | =====onderzoeksvraag===== | + | |
- | Annemarie Maes wil in het kader van haar artistiek-wetenschappelijk onderzoek naar Intelligent Guerilla Beehives (biologische afbreekbare bijenkorven die bijen onderdak bieden en fungeren als biosensor) nagaan of de cellulosehuid (die de bijenkorf omhult)kan worden omgezet naar een voedingsbodem voor kolonies van symbiotische bacteriën die op de huid zijn uitgegroeid tot een biofilm. Wanneer een (te) hoge pollutiegraad deze bacterieën onder stress zet veranderen ze van kleur en weerspiegelen ze op die manier de mate van luchtverontreiniging. | + | |
- | \\ | + | |
- | + | ||
- | =====voorstelling project SENSORIAL SKIN===== | + | |
- | AnneMarie Maes doet sinds een 10-tal jaar artistiek onderzoek naar stedelijke ecosystemen. Haar lange termijn projecten kunnen vervat worden onder de noemer ‘kunst/ | + | |
- | Als kunstenaar/ | + | |
- | Een van die oplossingen is ‘The Intelligent Guerrilla Beehive’. Dit project op het snijvlak van kunst en wetenschap is een onuitputtelijke inspiratiebron voor artistiek onderzoek naar vraagstukken over ecologie, architectuur en duurzaamheid van stedelijke omgevingen. Deze radikaal nieuwe bijenkorf heeft een dubbele functie: gemaakt uit intelligente organische materialen biedt de binnenkant onderdak aan zwermende stadsbijen, de buitenkant is een biosensor die de luchtvervuiling meet in de directe omgeving. | + | |
- | In vorige projecten (‘The Transparent Beehive’ en ‘The Soundbeehive’) | + | |
- | In 2016-2017 werkte AnneMarie Maes samen met biologen van de Universiteit Pompeu Fabra (Barcelona) deze theorie uit tot een ‘Proof of Concept’ en kreeg hiervoor een Honorable Mention in de categorie ‘Hybrid Art’ op het prestigieuze festival Ars Electronica in Linz (2017). Er werd geëxperimenteerd met bacteriële biofilms in vitro, onder gecontroleerde condities, in het lab van moleculaire biologie. De bacteriën reageerden naar wens op de (geforceerde) stress-situatie: | + | |
- | Nu, in de 2de fase, begint de zoektocht naar de juiste bacterie-stam die de taak van bio-pollutiesensor kan vervullen buiten het lab, op de reële Intelligent Guerrilla Beehive die geplaatst is in een natuurlijke setting. Hiervoor zal AnneMarie Maes, in het Open BioLab van Erasmushogeschool Brussel, samen met een moleculair bioloog en een assistent-laborant onderzoek voeren naar verschillende stammen van gepigmenteerde bacteriën. | + | |
- | + | ||
- | **Samenvatting: | + | |
- | + | ||
- | **beknopte achtergrond info:** | + | |
- | Mijn onderzoek strekt zich uit over verschillende niveaus: van experimentele stadstuinbouw, | + | |
- | De experimenten en kunstwerken die daaruit voortkomen volgen een complexe werkmethodologie waarvoor observatie uit de eerste hand (opgedaan in mijn openlucht laboratorium/ | + | |
- | In een vorig traject werden data voortkomend uit digitale monitoring van bijenkorven (‘The Transparent Beehive’, ‘The Soundbeehive’ - citizen science project, 2013-2016, AM Maes) geanalyseerd via gesofisticeerde patroonherkenning in samenwerking met met onderzoekers van het Artificiële Intelligentie-laboratorium van de VUB in Brussel. Vervolgens werd met computergraphics een visuele weergave gemaakt van deze informatie. De conclusies van deze observaties vormden de basis voor het concept van ‘The Intelligent Guerrilla Beehive’: nl. een overgang maken van informatie-technologie naar biotechnologie en het vanaf nul ontwerpen van een radicaal nieuwe bijenkorf. Een bijenkorf die is afgestemd op de behoeften van de bijen in plaats van op de productie voor de de imker. | + | |
- | \\ | + | |
- | + | ||
- | + | ||
- | =====the Intelligent Guerrilla Beehive===== | + | |
- | Op en in het object IGB vinden vele (biologische) symbiotische relaties plaats. Maar vooral is het een sculptuur, een uiting van creatieve verbeelding waarmee onderzoek gevoerd wordt naar mogelijke toekomsten. | + | |
- | + | ||
- | ‘The Intelligent Guerrilla Beehive’ is een fysieke sculptuur waarop bacteriële experimenten uitgetest worden in combinatie met onderzoek naar nieuwe materialen en digitale fabricagetechnieken (3D-printen, | + | |
- | + | ||
- | Nieuwe etappe in het onderzoek: | + | |
- | De bovenvermelde | + | |
- | + | ||
- | In deze ‘eerste etappe’ werd er geëxperimenteerd met biofilms in vitro, onder gecontroleerde condities in het lab van de moleculaire biologie aan de Universiteit Pompeu Fabra in Barcelona. De bacterieën reageerden naar wens op de (geforceerde) stress-situatie: | + | |
- | Maar nu begint echter de zoektocht naar de juiste bacterie-stam die de taak van bio-pollutiesensor kan vervullen buiten het lab. We zijn op zoek naar bacterieën die uitgroeien tot een biofilm en die in leven blijven omdat ze gevoed worden door de pollutie die in het ecosysteem aanwezig is. | + | |
- | Hiervoor wil ik, samen met specialisten (een moleculair bioloog en een assistent-laborant) onderzoek voeren naar verschillende stammen van gepigmenteerde bacterieën, | + | |
- | In ruil voor het gebruik van het lab en de uitrusting én voor de supervisie en overkoepelende assistentie door de labverantwoordelijke bioloog, zal ik zelf een reeks workshops uitwerken en geven in het Open Biolab o.a. het groeien van bacteriële cellulose, werken met Mycelium, natuurlijke verfstoffen maken met organisch materiaal, printen en verven met bacterieën, | + | |
- | + | ||
- | Eindresultaat & publieksbereik: | + | |
- | Publiek: verruiming kennisveld van de studenten, introductie tot bio-art van externe geïnteresseerden | + | |
- | \\ | + | |
- | + | ||
- | =====lactic acid bacteria===== | + | |
- | Lactobacillus plantarum als biosensor en als ondersteunende bacterie in de microbiome van de honingbij. | + | |
- | + | ||
- | Professor Sarah Lebeer is bio-ingenieur in de cel- en gentechnologie en als moleculair bioloog verbonden aan de Universiteit Antwerpen. Ze voert onderzoek naar bacteriën en de link met ons immuunsysteem, | + | |
- | Sarah Lebeer | + | |
- | Campus Groenenborger | + | |
- | Groenenborgerlaan 171 - G.V.521 | + | |
- | 2020 Antwerpen | + | |
- | Tel. 032653285 | + | |
- | sarah.lebeer@uantwerpen.be | + | |
- | \\ | + | |
- | + | ||
- | =====research on biofilms===== | + | |
- | A biofilm is an association of micro-organisms in which microbial cells adhere to each other on a living or non-living surfaces within a self-produced matrix of extracellular polymeric substance. | + | |
- | Biofilm formation is a cooperative group behaviour that involves bacterial populations living embedded in a self-produced extracellular matrix. QS is a cell–cell communication mechanism that synchronizes gene expression in response to population cell density. | + | |
- | In biology, quorum sensing is a system of stimuli and response correlated to population density. ... Many species of bacteria use quorum sensing to coordinate gene expression according to the density of their local population. | + | |
- | Genes encode proteins and proteins dictate cell function. Therefore, the thousands of genes expressed in a particular cell determine what that cell can do. | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[https:// | + | |
- | [[http:// | + | |
\\ | \\ | ||
Line 92: | Line 19: | ||
\\ | \\ | ||
- | =====lichen===== | + | =====slimemold===== |
- | Lichens can resemble plants but they are fungi with photosynthetic partners (algae and/or cyanobacteria) and live on a variety of substrates (e.g. trees, rocks, buildings) exposed to the environment. The fungi extract food from their partners in exchange | + | [[http://slimoco.ning.com/|Slime Mould Collective]]: |
- | https:// | + | facebook group: www.facebook.com/groups/slimoco/ |
- | https://en.wikipedia.org/wiki/Lichen | + | http://materiability.com/portfolio/slime-mold/ |
- | + | \\ | |
- | + | ||
- | + | ||
- | + | ||
- | =====bacteria as a reflecting shield, source of energy===== | + | |
- | * the plated cells of the coccolith | + | |
- | * ... reflected light shows the exact size and location of the coccolithophore blooms and other phytoplankton blooms | + | |
- | * the mitochondria that produce the energy in eurkaryotic cells were once free-living bacteria, idem dito the chloroplasts which harvest light energy in plants and algae cells were once free living photosynthetic bacteria, the cyanobacteria (Margulis) | + | |
- | * research naar ' | + | |
Line 112: | Line 31: | ||
Natural processes, raising awareness about non-human p.o.v. | Natural processes, raising awareness about non-human p.o.v. | ||
Aesthetical aspects of the process, political aspects (collaboration, | Aesthetical aspects of the process, political aspects (collaboration, | ||
+ | [[https:// | ||
+ | https:// | ||
\\ | \\ | ||
Line 117: | Line 38: | ||
[[http:// | [[http:// | ||
The composition of propolis varies from hive to hive, from district to district, and from season to season. Normally it is dark brown in color, but it can be found in green, red, black and white hues, depending on the sources of resin found in the particular hive area. Detailed analyses show that the chemical composition of propolis varies considerably from region to region along with the vegetation. In northern temperate climates, for example, bees collect resins from trees, such as poplars and conifers (the biological role of resin in trees is to seal wounds and defend against bacteria, fungi and insects). “Typical” northern temperate propolis has approximately 50 constituents, | The composition of propolis varies from hive to hive, from district to district, and from season to season. Normally it is dark brown in color, but it can be found in green, red, black and white hues, depending on the sources of resin found in the particular hive area. Detailed analyses show that the chemical composition of propolis varies considerably from region to region along with the vegetation. In northern temperate climates, for example, bees collect resins from trees, such as poplars and conifers (the biological role of resin in trees is to seal wounds and defend against bacteria, fungi and insects). “Typical” northern temperate propolis has approximately 50 constituents, | ||
+ | \\ | ||
+ | |||
+ | =====algae===== | ||
+ | the power of algae | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | \\ | ||
+ | =====to check===== | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | pdf wild fermentation | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[http:// | ||
+ | [[https:// | ||
\\ | \\ | ||
Line 122: | Line 76: | ||
[[https:// | [[https:// | ||
\\ | \\ | ||
+ | |||
+ | =====biofilms====== | ||
+ | Dr. Katrin Hammerschmidt (WIKO biologie workshop, Kiel Germany) | ||
+ | https:// | ||
+ | [[https:// | ||
+ | \\ | ||
+ | |||
+ | =====seaweed and eucalyptus as primary materia===== | ||
+ | [[https:// | ||
+ | http:// | ||
=====growing cellulose skins in the biolab (04.2018)===== | =====growing cellulose skins in the biolab (04.2018)===== |
biolab_brussels.txt · Last modified: 2019/02/05 11:43 by ami